Помпеи ДНК

Свободный форум.
Ответить

Igor07
Сообщения: 146
Зарегистрирован: 01 июл 2014, 21:56
Благодарил (а): 2 раза
Поблагодарили: 6 раз

Помпеи ДНК

#1

Сообщение Igor07 »

"удалось впервые полностью секвенировать геном человека, погибшего в Помпеях при извержении Везуви"

https://www.nature.com/articles/s41598-022-10899-1

Алистейн
Сообщения: 155
Зарегистрирован: 08 дек 2021, 00:28
Благодарил (а): 28 раз
Поблагодарили: 38 раз

Помпеи ДНК

#2

Сообщение Алистейн »

Воды много, но про Y - хромосому ни гу-гу.

Алистейн
Сообщения: 155
Зарегистрирован: 08 дек 2021, 00:28
Благодарил (а): 28 раз
Поблагодарили: 38 раз

Помпеи ДНК

#3

Сообщение Алистейн »

Алистейн писал(а): 31 май 2022, 10:20 Воды много, но про Y - хромосому ни гу-гу.
Ан нет, кое-что нашлось, но что можно понять из этого:

"Для анализа мтДНК были использованы консенсусные последовательности митохондрий, и гаплогруппа была назначена с использованием версии командной строки HaploGrep227,28.
Размещение гаплогруппы Y-хромосомы было сначала выполнено с использованием PathPhynder99, программного обеспечения, предназначенного для размещения древних и / или малообеспеченных особей в филогении с высокой степенью достоверности. В то время как PathPhynder смог поместить индивидуума A в дерево, нехватка общедоступных индивидуумов из гаплогруппы A препятствовала более высокому определению. Затем мы продолжили использовать ANGSD97 для вызова генотипов во всех филогенетически информативных сайтах, перечисленных в ISOGG. Эта кураторская база данных была разделена на варианты перехода и трансверсии, чтобы позволить использовать различные фильтры, принимая во внимание древние повреждения ДНК, которые проявляются в основном через переходы25. Были названы только варианты с частотой более 95% в популяции неклональных считываний в локусах. При вызове вариантов перехода было обрезано 7 оснований."
Ответить